ShyFile สามารถทำงานได้สามอย่างหลักๆ ดังนี้

Random Key Generatorทำการสร้าง Random Number ขึ้นมาเพื่อใช้ในการเข้ารหัสและถอดรหัส โดยมีใช้ Function Random Number Generator ของทางบริษัทเองซึ่งจะใช้ตัวเลขที่ผู้ใช้งานใส่เข้าไปในโปรแกรมตอนที่ทำการลงโปรแกรมเป็นครั้งแรก key ที่ทำการ generate ขึ้นมามีความยาว 1024 ตัวอักษร ทำให้การทำการทำ key snooping หรือ key analysis ยากมากSecure Private Chatการทำการสนทนาผ่าน Internet Chat ที่มีการเข้ารหัสข้อมูลที่ส่ง ซึ่งการที่ผู้ที่สนทนาจะสามารถอ่านข้อความที่ส่งได้ จะต้องมี key ที่ทำการตกลงไว้ก่อน key ที่ตกลงไว้อาจจะเป็นข้อความสั้นๆ หรือเป็นไฟล์หนึง หรือเป็นข้อมูล random ที่ shyfile สร้างขึ้นมา user ที่ต้องการใช้งานไม่จำเป็นที่จะต้องทำการ register username ใดๆ ทั้งสิ้น ผู้ที่ประสงค์ที่จะสนทนากัน สามารถทำได้ทันทีถ้ามี key เดียวกันFile Encryptionการทำการเข้ารหัส File ที่ต้องการ โดยใช้ key ที่มีที่มาเช่นเดียวกับ Secure Private Chat ซึ่งการทำการ เข้ารหัสนี้ สามารถทำเป็น file เดี่ยว หรืออาจจะทำการ encrypt ทั้ง folder หรือ สามารถทำได้กระทั่ง encrypt หน้าเวป site ซึ่งจะทำให้คนที่มี key เท่านั้นถึงจะสามารถเข้าดูเวปนั้นได้Shredderการทำการลบ File อย่างถาวรโดยการเขียนข้อมูลทับเป็นจำนวน 7 ครั้ง เปลี่ยนวันที่และชื่อ file และสุดท้ายก็จะทำการลบ file ซึ่งจะต่างจากการลบ file ธรรมดา ที่แค่ทำการลบทะเบียน file ออกจาก directory เท่านั้น แต่ตัว file ยังอยู่ครบถ้วน